誘導されてきました。
再掲します

他の人も同じ条件で下記が再現するか試してほしい。

タブを複数開く
↓
habitをメニューなどから終了
↓
habitを起動※
↓
habitを再び終了
↓
habitを起動すると※の時点でアクティブにしなかったタブだけが全て、1つ前に開いていたページに戻っている

私の環境では必ず再現

この現象は「消える」というよりは「タブの状態が一つ前の状態に戻る」。戻ることができない場合だけタブが閉じられる。
ただ、戻ってしまった状態からは「進む」ボタンを押すことができないから戻るボタンが押されているというわけではなさそう

2chMate 0.8.9.11 dev/asus/ASUS_Z00ED/6.0.1/LR
初期化直後のXperia Z3Cでも再現

Habit Browser v1.1.74