内部ストレージ(/sdcard配下)にデータをいっぱい入れてるとかじゃないの？
ストレージはシステム(メインOS)もデータ(アプリ等)も
内部ストレージ(アプリの生成したデータ、撮影写真、自分で入れたデータ)も
すべて共用だから、どこかが使えば他も空き容量は減る