すまん、色々試してて時間かかった、スペックはこんな感じ
【OS】Windows 7 64bit
【CPU】Interl Core [email protected]
【メモリ】16GB
【グラボ】GeForce GTX 660
MEmuHeadless.exeのCPU使用率が明らかに異常な数値出してたから、多分CPUが問題なんだろうけど
VT無効にすると全然消費しない上に動作が軽くなる。Noxも試してみたけど同じだった