ちょいと古めだが、mix2でimei書き換えが成功したので、整理しておく。
・miui global stable 8.5.1.0
・DFS tool v.17.10.02
・qpst v.2.7 build 472

1)diag modeにて、DFSでNVファイル一式をバックアップ
2)qpstでqcnファイルをバックアップ
3)手順2のqcnファイル内のimei部分をバイナリエディタで編集
4)adb shellのroot権限にて、
modemst1, modemst2, fsgの各ブロックをzero埋めしてリブート
5)DFSで手順1のNVファイルをリストア（上書きコピー）
6)qpstで手順3の編集済みqcnファイルをリストア
7)DFSで手順1のNVファイルを再度リストア（上書きコピー）
8)リブート

参考にしたのは、ガジェットフリーク下記記事のコメントより
https://mymobile-wifi.com/volte-sim-au-nano-ic-card-04