785で回答したものだけど、表示させたいなら#enable-tab-switcher-on-returnをdisabledにすればいけると思う
俺は実際にデフォでアイコンが表示されていなかったのをこれをdisabledにすることでアイコンを表示させることができた

ただ俺が試してたのはCanary版だし、A/Bテストは人によって様々だからこれじゃ解決しないかもしれないけどね
そもそもNewTabPageのデザインに#enable-tab-switcher-on-returnが関係してるのもなんか変な挙動だし
このflagで変わるのは当時のCanaryだけだった可能性もある