rootを取らない前提で目立った制約というと
通知系の機能は使えない（メールなど、アプリそのものは動く）
ホームアプリの変更不可（無理やり割り込むやつはあるが、重いし不安定だから推奨されない）
くらいだろね
あとは、性能故に無理なことと、GP入れるとGPと尼ストアで競合してうまく動かないことがあること（アプリからストアへの自動遷移がこけるとか、尼純正アプリがGPのものに置き換わって動かなくなるとか？）