Fireが独自のOSになると対応アプリが今よりもっと少なくなる
OS開発だけでなくそれに対応するために自社アプリの開発リソースも増えてしまう

AndroidベースでAndroid端末との互換性もそこそこ有って有利なはずなのにFireOSが広まらない現状で今さらオリジナルのOSに参入するメリットは無いでしょう