LINEとかのモジュールに関しては、こっちからコマンド叩いてるんじゃなくて端末で受信したデータを割り振ってるだけだから特に問題ないと思うんだよね

こっちから、例えばAPI割り込みコマンドとか改変するようなことをしたらログ取られるだろうしそりゃあBANされるだろうけど、受信したデータを端末上の別システムで読もうがどうしようが、サーバー側に送信しなきゃ関係ないと思うよ