薬剤師と登録販売者の未払い残業代、ワンオペ分、未取得休憩時間分請求は、比較的簡単だと思うけどな。
自分のタイムカードデータと他の店舗在籍の有資格者のタイムカードデータを照らし合わせて自分の出勤日、出勤時間と重複してなければ、ワンオペの休憩分は証明完了。
ただ、会社がタイムカードの改ざんをしていないという前提だけど。