そもそもバイパス時の音痩せが再現できてなくない? 

インから入った信号はバッファー回路を通るんだわ その後他の回路スルーしてアウトに出る トゥルーバイパスなってない
そのバッファー回路はオペアンプかトランジスタが使われててるんだが(マイクプリならトランス)

必ず広域に独自のEQ感がかかるし コンデンサにセラコンが入ってれば広域がかすかに歪む
さらにACを変換してる電源トランジスタでも音が変わるしDC安定化してる三端子レギュレーターが既に電源ノイズを出してる
オペアンプの電源ピンについてる電解コンデンサでも低域の音の立ち上がり方がぬるくなってダイナミックレンジが少し狭まる 

更にIR作ってるときに使うADC DCAラインアンプの影響もあるはず