母親は死んでなくて
創造生物（エヴァ）と完全に融合してしまっていて
神（疑似シン化形態なんチャラ）に等しい存在になってるんじゃねーの
その魂を引き上げたいから研究に没頭しているラハブレア（ゲンドウ）
その息子（エリクトニオス）が鍵になっている