https://stopcovid19.metro.tokyo.lg.jp/ によると
2020/3/24 11:00時点で検査人数での陽性率は171/2013であるという。
新型コロナ肺炎のPCR検査の感度は5〜7割、特異度は9割前後らしい。
幅をもたせた値を使って検査をうけたグループの有病率を計算してみる。
感度は最頻値が0.6標準偏差0.1、特異度は最頻値が0.9標準偏差0.05として
0-1が定義域であるベータ分布を、検査をうけたグループの有病率には情報がないので一様分布(0,1)を仮定する。
stanを使ってベイズ階層モデルでの結果。
有病率
mean lower upper
0.04284030 0.00000552 0.10311931
ついでに感度・特異度・陽性率の期待値や信頼区間も計算してくれる。
mean se_mean sd 2.5% 50% 97.5% n_eff Rhat
prev 0.0428 0.0004 0.0324 0.0017 0.0364 0.1191 6088 1
sen 0.5703 0.0012 0.1037 0.3641 0.5720 0.7663 7569 1
spc 0.9346 0.0002 0.0159 0.9096 0.9322 0.9699 5901 1
p 0.0866 0.0000 0.0063 0.0746 0.0863 0.0992 19823 1
lp__ -621.5293 0.0184 1.2999 -624.9029 -621.1886 -620.0395 5017 1
底辺私立医大を卒業した医者って頭悪いよね? Part15
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161卵の名無しさん
2020/03/25(水) 07:50:43.02ID:C3cAic+l■ このスレッドは過去ログ倉庫に格納されています
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