＞要するに、西浦さんは実効再生産数２．５（２．４）にして計算したってだけのことでしょ？
再生産数の事前分布も西浦のソースではRt　~ normal(2.4 ,2)

この事前分布での95%CIは
> hdi(qnorm,0.95,mean=2.4,sd=2)[1:2]
lower upper
-1.519928 6.319928
なので、０も含んでいる。

この事前分布が実際のデータによりどのような事後分布になるかを算出しただけの話。