mds-crash-state」なるファイルが作成されていないかを確認。
このファイルは、Spotlightのインデックスファイルを更新するプロセス(※)が異常終了したときに作成され、
存在するかぎりインデックスファイルが更新されない

発見次第、mds-crash-stateを削除し(sudo rm /mds-crash-state)、
mdutilコマンドを実行してインデックスファイルを再構築

どう？