モード設定の変更前に作成した書類は、
「ドキュメントの各種設定」の方をいじらない限り、古い設定のままだよ。

変更後に新規作成した書類にも反映されないなら、
「文法定義〜」とか「行の正規表現〜」の設定内容が優先されてたりするのかも。