フルバックアップは成功するも以降に追加した動画ファイルなどのバックアップ漏れ再び発見
（バックアップHDDを「ディスクを検証」にかけるも問題ないとのこと）

「OnyX」「アクセス権の修復」「セーフモード起動」「SMCリセット」「PRAMクリア」

上記をそれぞれ１つずつ実行後にその都度、再バックアップを試すが解決せず（漏れるのは同じファイル）
失敗した日付のバックアップはその都度、削除

偶然かもしれないが最後に、
「インストールディスクから起動し、ディスクのアクセス権の修復」でバックアップ成功

これで次回もバックアップ漏れ再発なら、macOSの再インストールを試すしかない