日本語・欧米語の合成フォント設定を今の1つから明朝体・ゴシック体別の2つに増やすか、ユーザー定義テキストスタイル(本文はマークダウン記号で指定)の複数指定を外部テキストファイル(CSS3形式記述)から読み込めるようにして欲しい。
そういうことはマークダウンエディタでやれって言われそうだけど(ルビを含む)縦書き多段組みに対応したツールは存在しないから。