Thunderboltは規格
USB-Cはコネクタ形状

TBとUSBはプロトコル（論理層）が別物
同じなのはコネクタ形状だけ（Type-C）

TB3の方が速いけどコストが高い
https://ja.wikipedia.org/wiki/Thunderbolt

だったんだけどTB2までは
TB3からUSB3.1,DPの機能が内包されてしまったことで
そうとも言い切れなくなった

> Thunderbolt 3には、USB 3.1 Gen2の機能と、Alt ModeによりDisplayPort機能も内包されています。
> なので、PCにThunderbolt 3ポートが存在しているなら、それはUSB 3.1 Gen2としても、DisplayPortとしても機能することになります。

・TBとUSBは別物
・TB3はUSB3.1との互換性を得た

・USB3.1はTBのデバイスは使えない
・TB1/2はUSBのデバイスは使えない（コネクタもFireWire）
・TB3はTBとUSBが使える（コネクタはType-C以外は変換が必要）