buffaloのがどうかは知らないが、昔のNECルータの簡易NASだと直接MacやWin機に挿した時
表示されないファイルがあったり逆に直接書き込んだファイルがNASに戻した時
出てこなかったりした

USBメモリにでも旧OSインストールして、それで一時的に立ち上げて接続してコピーしてみたら？