みなさん、いろいろと考えてくださりありがとうございます。

>>269
El Capitanは10.11.4
Safariは9.1です。

>>265
環境設定で、クッキーとウェブデータの全消去
Mac自体の再起動はやっています。
ただ、履歴は消していなくて「最後のセッションの全ウインドウを開く」を使ってます。
これで、すでに開かれているyoutubeについては、１、２回は問題なく再生できたりしたので、謎です。