アクティブなウィンドウはメニューバーのウィンドウからわかる
ウィンドウの循環操作は
設定＞キーボード＞キーボードショートカット＞キーボード
にある「次のウィンドウを操作対象にする」で可能(アプリ別にオーバーライドしてなければ)