CCCでバックアップした壊れたOSから再インストールOSに一部の環境を手動で復元するには
何のファイルを戻せばいいでしょうか？

MacOS 10.9 Mavericks(MacBool Air 2014 11インチ)がディスクユーティリティの First Aidで直らず
すぐバックアップしろといわれグレーアウトして起動はもちろんファイルを移動する事も出来なくなりました。
（アクセス自体はまだ出来ます）

そこでUSBメモリに起動ディスクを作りそこからCCCで外付けHDDに個人ファイルと壊れた起動ディスク丸ごと(システム+個人データ)をそれぞれコピーしました。

Safari,Google Chromeの履歴,ブックマーク,機能拡張,と覚えさせた各サイトパスワード、Finderと環境設定の各設定、
これらをなんとかしたいです。

あと再インストール時のユーザ名を旧と揃える方が無難と思うのですが、ユーザフォルダからユーザ名しか判りません。
他Mac製品とはひも付けされてませんので復旧の都合だけで大丈夫ですが,揃えないと想定できる不都合はありますか？

前述の通りネット環境とfinderなどのファイル操作環境の復元が目的となります。
よろしくお願いいたします。