Time Machineについて質問していた者ですが解決しました
>>116の条件で先ずは外付けHDD全体除外対象とすることで初回バックアップ完走
その後少しずつ外付けHDDの中のフォルダを除外対象から外していくと全体容量1TBほどでバックアップできました
バックアップ対象のフォルダの総量は変わっていない筈なので疑問は残りますが…