AppleStoreのCTOもオーダー毎に組んでるわけじゃなくて組み合わせ毎に在庫持ってるでしょ
量販店のECサイトは画面の都合でああいう風になってるだけだよ
どのみち注文受けてからAppleに発注するんだから本来は組み合わせを限定する必要はないはずで、
Appleと量販店の間のライセンス契約の都合とか、Apple側で極端な組み合わせは生産数が少なくてチャネルを絞ってたりとか事情があるんだろう