クリーンインストール手順は前スレの119さんの手順が有益だと思うので、貼らせていただきます。

119 名前:[Fn]+[名無しさん][sage] 投稿日:2016/12/10(土) 22:25:43.22 ID:g/VBJ6fs [2/2]
PORTABOOKに限らず、ストレージの狭いPCに1607入れたいなら
1・1607のインストールイメージをダウンロード→USBメモリをつくる(4GB以上のものを用意)。
https://www.microsoft.com/ja-jp/software-download/windows10
2・プロダクトキーのデジタル認証が取れてることを確認。
3・1でつくったインストーラをWindows上で起動してアップデート、またはUSBメモリから起動してクリーンインストール
※クリーンインストールの場合途中で入力が効かなくなる場合があるのでUSBのキーボードとマウス用意。

これが一番手っ取り早くて確実だよ。メインのストレージに展開用のテンポラリスペースも最小限で済むし。

126 名前:[Fn]+[名無しさん][sage] 投稿日:2016/12/11(日) 18:18:29.53 ID:MsrNA9x/ [1/2]
>>125
あー…ごめん、プリインストールドライバのバックアップのこと書き漏れてた。
今後やるかたは119にコレ加えてください。

a・現在使用中のデバイスドライバのバックアップ
http://news.mynavi.jp/column/win10tips/137/
B・クリーンインストール後aでつくったバックアップの復元
http://news.mynavi.jp/column/win10tips/138/

DoubleDriver等、これをGUIで出来るソフトもあるんだけど、ここでは念のため手動で。

eMMCの内容をなんらかの方法でまるっとUSBメモリにでも複製しといてドライバあてる時に
そっちを検索させるのでも良いと思うけどね。VHD化してMicroSDXCにでも入れとくとか。