【医学】新型コロナは世界にどう広がったのか？ 遺伝子解析で追跡

科学者たちは、新型コロナウイルスの遺伝子変異をリアルタイムで追跡している。遺伝情報から、ウイルスの進化の様子や、各国に複数の経路で侵入している事実が明らかになってきた。
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新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）がこれまでにない規模で世界的に広がる中、ウイルスの遺伝物質から、感染経路だけでなく、世界での広がり方や封じ込めに失敗した状況が、最終的に分かるかもしれない。

科学界では、ウイルスの感染拡大に伴う遺伝子変異を追跡することで、ほぼリアルタイムで系統樹が作成されている。この系統樹は、感染が国から国へ飛び火する様子を特定するのに役立つという。

ブラジルの科学者たちは、2月下旬に国内初の新型コロナウイルスの感染例を確認した際、すぐにウイルスの遺伝子配列を解読した。そして、すでにオンライン上で公表されていた150以上の配列（多くは中国からの情報）と照らし合わせた。

感染者はサンパウロ在住の61歳で、2月にイタリア北部のロンバルディア地方を旅行していたため、イタリアで感染した可能性が高いと思われていた。しかし、感染者のウイルスの遺伝子配列は、さらに複雑な履歴を物語っていた。それは、感染した状態で中国から来た渡航者が、ドイツでのアウトブレイクならびにその後のイタリアでの感染拡大に関連するというものだった。

ウイルスは流行と共に変異し、ゲノムの塩基がランダムに変わる。科学者たちは、そうした遺伝情報の変化を追跡することで、ウイルスの進化の様子や、最も密接に関連する事例を辿ることができる。最新の系統樹では、すでに多数の分岐が示されている。

新型コロナウイルスの遺伝子データは「ネクストスレイン（Nextstrain）」というWebサイトで追跡されている。ネクストスレインは、「病原体のゲノムデータの科学的・公衆衛生的な可能性を活用」するためのオープンソースの活動だ。科学者たちがすみやかにデータを投稿しているおかげで、アウトブレイクとしては初めて、ウイルスの進化と拡散がかなり詳細に、ほぼリアルタイムで追跡されている。
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ゲノムの探索は、封じ込め対策が失敗している場所を知るのに有効だ。各国が、1つだけでなく複数の経路でウイルスに直面していることも明らかになっている。そして最終的には、遺伝子データから、大流行の最初の発生源を突き止められる可能性がある。

「ブラジルでは、研究者が遺伝子データを用いて、最初の症例とその後に見つかった2番目の症例の間に密接な関連がないと示すことができました」と、オックスフォード大学のヌーノ・ファリア准教授は言う。2人の患者のウイルスから採取した遺伝子サンプルには、それぞれ別の場所で感染した可能性が高いことを示すだけの十分な違いが見られた。

「患者の渡航歴と組み合わせた結果、ブラジルで判明した2つの症例は、それぞれ別の経路で国内にウイルスを持ち込んだのだと分かりました」。自身の発見について、ファリア准教授はそう考察している。

続きはソースで

https://www.technologyreview.jp/s/190754/gene-sleuths-are-tracking-the-coronavirus-outbreak-as-it-happens/

イタリア、イラン死にすぎだけど違うんかね

母子感染で赤子に後遺症とか出ないだろうな？

中国人がどんどん国外に逃亡して
感染が世界に広まった。
何かあれば自分だけ外国に逃亡は中国の歴史。

日本と言うか、世界が知ったときにはもうチャイニーズが世界中に拡散してたからな

もともと７種類のコロナウイルス。それが世界中で、

ドンドン変異していってる。

これ相当ヤバイよ。

変異しやすいって事は
それだけ最初から不安定な株だったって事で、
やっぱ研究所から漏れたって事かな。

葵英文が知らないプランだから問い正すと言い掛かりだー！と語るで

厚労省の検査拒否は無駄だったｗ

今回は震災とか台風の時以上に流言飛語やら陰謀論も酷いなこの辺も研究してほしいわ

ビッグバンもこうやって誕生したんだなって思える

人類滅亡しちゃうしやっぱり各国引きこもって人の交流はやめにしよう
ものだけが行き来できる世界

家庭菜園と昆虫食で自給自足ができる

「クラスターが特定され、「封じ込め」られたからといって、大流行になるまで気づかないような
感染連鎖の発生源にならないわけではないという、極めて重要な学びを得ることが出来ます」と、
ベッドフォード博士はツイートしている。

ウイルス追跡チームは、そのような事態がまさに米国のワシントン州で起きたのではないかと考えている。
ワシントン州では、最初の感染例が6週間近く前に発見された。しかし、2月に新たな症例のウイルスの
遺伝子配列を解読したところ、最初の感染例に特徴的な変異との共通点が見られた。

つまり、2つの症例は関連しており、その間ずっと新型ウイルスが米国内で静かに広がっていたことになる。
以降、ワシントン州では27人の感染と9人の死亡が報告されており、中には適切な診断がなされないまま早期に
亡くなった事例も含まれている。

ワシントン州のアウトブレイク以降、米国疾病予防管理センター（CDC）がウイルス検査の対象を制限したことで、
実質的に専門家がアウトブレイクに関与できない状態となっていることに対して批判が起きている。

なるほど。武漢→イタリア→ブラジルかと思ったら、
上海→ドイツ→イタリア→ブラジルだったと。

結局始まりは中国じゃんか。

なんかアメリカの専門家が日本のクルーズ船の対応批判してたんでしょ？その間自分たちの足元で感染広がってたとか何かの喜劇かね

地図見たけど、同じ色が同じ系統ってことかなぁ？

すごい分岐だな
どこかで専門の人が、どんどん変異していって最終的には弱毒化する
みたいなニュアンスのことを言っていたが本当だろうか

>>16
日本もそうだけどアメリカの断行措置なきゃあんだけWHOさわがんかったし
すでに後手だったんだよ
今回のウイルスは感染力半端ない

>>18
普通はそうしないと生きてけないからウイルスは

まあ細菌0がむりなようにいかにして免疫がおだやかに働くようにするかしかないかな

武漢では9月から蔓延していた説もあるよね

リカチョン

素敵な異性に遭ったり列車で相席なスポーツ誌購読するイケメン男性に感じる
いつの間にかショーツに広がるしみが分かり、急ぎトイレ駆け込み

>>21
そういえば、アメリカのインフルは10月から流行が始まって
今年は流行るのが早いって言われてたんだよね

イランに流出したのが一番ヤバいのだと思うけど、データ無いのか

坂大森下教授開発ワクチン治療薬、
直ぐに認可して下さい安倍さん、
無能東大卒厚生官僚は組織改革を、
スパイクした突起物のコロナウイルスに
中身のない無毒スパイクしたワクチン治療薬、
凄い薬開発者、偉いよくやった、

>>4
まあ重症になったら生きたまま焼かれる国だからな
逃亡する気持ちは分かる

新型コロナウイルス｢生物兵器論｣は本当なのか
専門家見解｢人工で製造することは不可能｣
https://toyokeizai.net/articles/-/329766

>6
太陽黒点の消失による磁場低下で宇宙放射線が増えて変異が加速しているのかな