＞虫と人と細菌では世界の捉え方も異なります

その捉え方が繰り返しますが、
あなたの水平思考にある限界になっているのです

＞数が確率に支配されてしまう部分

あなたのいう確率という概念が、
どこから産出されているものなのかを自問すること

＞点から線が作れるのか疑問に感じました

それを作っているのは何ですか？誰ですか？
少なくても数学（論理学になりますが）はそれを証明できていません

＞最小単位間での有限時間での移動

単位と時間を分けて固有的に捉えているから、
解きたい問題のスケールにおいて矛盾に感じてしまうだけです

＞不定Rというのはどこからというものは数学的に定義出来ないんですね

あなたのいう数学的な定義というものを、
どのような尺度を用いて、ということで自覚化できれば、
おそらくあなたがあなた自身で迷妄してしまう状態を溶解できると思います