【ナショジオ】「最古のイヌ」の証拠を発見、1万4000年前　ヨーロッパの大規模調査で明らかに [すらいむ★]

「最古のイヌ」の証拠を発見、1万4000年前　ヨーロッパの大規模調査で明らかに
ヨーロッパ全域に似た飼いイヌ、定説を約3000年更新　家畜化の起源はいまだ謎

　イヌの起源を探る2つの研究で、確実にイヌと断定できる最古の証拠が見つかった。
　最古の個体の年代はこれまで約1万900年前とされてきたが、ヨーロッパ各地の遺跡から発見されたイヌ科動物の遺伝子を比較したところ、少なくとも1万4000年前にオオカミとは明らかに異なるイヌがいたことが明らかになった。
　論文はいずれも2026年3月25日付けで学術誌「ネイチャー」に掲載されている。

（以下略、続きはソースでご確認ください）

ナショナル ジオグラフィック日本版　6/26(金) 11:02
https://news.yahoo.co.jp/articles/9524949e91e6c260b332ed0e60089acae8973f37

>>1
おや、中東からやっと遡ったのか
そのうえDNAともけっこう差が縮まってきたな

>>1
>「動物を人間のそばに埋葬する行為は、その動物が家畜化されていたと断定する根拠としては弱いです。何千年もの間、人々は人間と野生動物を一緒に埋葬してきたことがわかっています」
>
>　イヌとオオカミの骨格は、特に頭蓋骨の一部や歯一本しか手がかりがない場合、驚くほど似通って見えることがある。「非常に古い時代のイヌと推定される個体の多くは、DNA検査を行うと、実際にはオオカミであることが判明します」と英ロンドン自然史博物館の古遺伝学者ウィリアム・マーシュ氏は言う。

それはそうなんだけど
イヌの系統樹に収まらなくても
イヌに準ずる生活をしていたオオカミもいたかもしれない
遺伝子を残せなかっただけで
骨に細工されたオオカミはいないのだろうか

中国でイエネコ以前にヤマネコと共存していた証拠も見つかったようだし

>>2
酷いタイトルだったが
確定した最古の犬はトルコの遺跡から発掘されたもので
しかもヨーロッパで見つかったモノとは大幅に異なる

ヨーロッパの犬の家畜化はほぼこれで確定で
東ユーラシアからもたらされたもので決定

「最古のイヌ」の証拠を発見、1万4000年前　ヨーロッパの大規模調査で明らかに
6/26(金) 11:02配信


ナショナル ジオグラフィック日本版
ヨーロッパ全域に似た飼いイヌ、定説を約3000年更新　家畜化の起源はいまだ謎
2つの新たな遺伝子解析で、トルコにある1万5800年前のプナルバシュ洞窟遺跡（上のイラスト）を含むヨーロッパ各地の古代人類遺跡から採取したサンプルを用い、飼いイヌの考古学的記録が詳しく調査された。（KATHRYN KILLACKEY）

　イヌの起源を探る2つの研究で、確実にイヌと断定できる最古の証拠が見つかった。最古の個体の年代はこれまで約1万900年前とされてきたが、ヨーロッパ各地の遺跡から発見されたイヌ科動物の遺伝子を比較したところ、少なくとも1万4000年前にオオカミとは明らかに異なるイヌがいたことが明らかになった。論文はいずれも2026年3月25日付けで学術誌「ネイチャー」に掲載されている。

スイスでもトルコでもイングランドでも

　ベルギーにある4万6000年前のゴイエ遺跡から英スコットランドの5000年前の骨格まで、数千年にわたって人間の近くに埋葬されてきたイヌ科動物216頭のサンプルをベルグストローム氏らは採取した。そして、DNAから再構築できた情報を比較し、イヌとオオカミを区別する作業を行った。イヌと判定された最も古いサンプルは、スイスの遺跡から出土した1万4200年前のものだった。

　一方、スカーズブルック氏とマーシュ氏の研究チームはトルコ、イラン、セルビア、イングランドで発見されたイヌ科動物8頭のサンプルを採取した。これらの骨は1万5800年から8900年前のものと推定される。チームは細胞核内のDNAに加えて、母親からのみ受け継がれるミトコンドリアDNAも解析した。

　その結果、8頭中6頭がイヌだと判明した。6頭すべてがかなり類似しており、1万4300年前までにヨーロッパ全域で一貫したイヌの系統が存在したことを示唆している。

　これらの研究から初期のイヌの外見までは推測できない。だが、研究対象となったイヌたちはおそらく、かわいい服を着たポメラニアンのような姿ではなかったはずだ。

「彼らは小型のオオカミに似ていたのではないかと推測しています」とスカーズブルック氏は言う。しかし、これらのイヌの遺伝子は受け継がれ、「ジャーマン・シェパードやセント・バーナードなど、私たちがよく知っている多くの現代犬種に受け継がれました」

>>1
>家畜化の起源はいまだ謎

全ゲノム解析で系統樹が確定してますよ
起源は東アジアです
まさか種は分岐してても家畜化は欧州で行われたとか言い出すのかな

めんどくさくなったのでいきなり逝くことにした
注意点はNGSDとNGDが同時に出るから
混乱しないように


ヨーロッパ大陸は、現代の犬の起源において重要な役割を果たしたと考えられている。本研究では、ドイツで発見された2つの古代犬のゲノムを解析し、新石器時代を通じて顕著な遺伝的連続性があることを明らかにし、犬の家畜化は約2万～4万年前であったと推定した。

ヨーロッパは犬の歴史と進化において極めて重要な地域であり、現代の犬種のほとんどは主にヨーロッパの祖先を共有している1 。さらに、イヌ ( Canis lupus familiaris )に間違いなく帰属できる最古の遺物は、ドイツのボン・オーバーカッセル遺跡から出土した14,700年前の後期旧石器時代の顎骨2など、この大陸で発見されている(シベリアや近東から提案されたより古い標本は依然として非常に議論の的となっている3、4 )。
古代のミトコンドリア DNA (mtDNA) は犬の家畜化の中心地がヨーロッパであることを示唆しているが5、現代の犬のミトコンドリアおよびゲノムデータの分析では、東アジア6、7、中東8、中央アジア9が示唆されている。

中央ヨーロッパの新石器時代は、約7,500年前から4,000年前までで、人間の文化の特定の特徴に基づいてさらに細分化することができます10（補足表1 ）。複数の研究により、新石器時代後期から現在までの間にイヌ科動物のミトコンドリアDNA系統の先史時代の交代があった証拠が見つかっており、新石器時代の犬のほぼすべてに見られるが現代の犬の10%未満にしか見られないハプログループCが、ヨーロッパの大部分でハプログループAに置き換えられています5、11、12。

Frantzら12は、現代の犬とニューグレンジの後期新石器時代（約5,000年前）のアイルランドの犬（以下NGDと呼ぶ）のゲノムデータを分析することで、この母系交代は新石器時代の大規模な人口置換の結果であると主張しています。しかし、NGDは主に現代のヨーロッパの犬と祖先を共有しており、提案されている個体群の置き換えはこの個体が生きる前にほぼすでに起こっていたことを示唆している。Frantzら12は、比較的最近の東西の犬の分岐（14,000～6,000年前）も推定しており、既存の考古学的データに照らし合わせると、犬の家畜化の二重起源で説明できる。

ミアキス

>>8

新石器時代初期およびヨーロッパ大陸のサンプルを特徴づけることは、この期間に大規模な人口置換が起こったかどうか、またどの程度起こったかを検証するために必要である。これは、新石器時代初期から現在までのゲノムの連続性とは対照的に、現代の犬のゲノムには存在しない、新石器時代初期の犬に顕著に見られた明確な祖先によって証明されるだろう。そこで、我々は、新石器時代初期と末期（それぞれ約7,000年前と約4,700年前）に遡るドイツの2つの犬のサンプルの約9倍カバレッジの全ゲノムの解析結果を示す。

我々は、この時代から現在に至るまで遺伝的連続性を観察し、古代の犬が現代のヨーロッパの犬とかなりの祖先を共有していることを知った。大規模な人口置換の証拠は見つからず、むしろ、我々の結果は、現代のヨーロッパの犬が構造化された新石器時代の集団から出現したというシナリオと一致する。

さらに、新石器時代末期のサンプルには、ヤムナヤ文化や縄目文土器文化¹³など、新石器時代後期から青銅器時代初期にかけての文化に関連するステップの人々と共に移動した可能性のある、さらに東に位置する犬の集団からの混血と一致する追加の祖先成分が検出されました。

また、家畜化に関連する常染色体ハプロタイプのほとんどが新石器時代の犬にすでに確立されていたものの、デンプン質の多い食事への適応はおそらく後になって起こったことも示しました。

最後に、東西の犬の間の分岐推定値は17,000～24,000年前であり、家畜化の単一の地理的起源と一致し、その時期は20,000～40,000年前の間に絞り込まれました。

犬を家畜化したんじゃなくって
オオカミを家畜化して犬になっていったんじゃないのか？

>>11
事実としてイヌには単一の祖先がいるし
オオカミの伝搬とは別の波だった

これは山猫とイエネコの関係でも同じ

結果

考古学的試料と古代DNAの配列決定
より古い標本（以下、HXHと呼ぶ）は、ヘルクスハイムの初期新石器時代の遺跡で発見され、紀元前5,223～5,040年（約7,000年前）と年代測定されている（補足図1）。より新しい標本（以下、CTCと呼ぶ）は、チェリーツリー洞窟で発見され、紀元前2,900～2,632年（約4,700年前）と年代測定されており、これは中央ヨーロッパの新石器時代末期に相当する（補足図2および補足ノート1～3）。

我々は2匹の古代犬の全ゲノム配列データを生成し、リードの67%以上を犬の参照ゲノム（CanFam3.1）にマッピングし、両サンプルで高い内因性犬DNA含有量を確認した（補足表2および補足ノート4）。MapDamage 15解析により、両サンプルが古代DNA 16に典型的な損傷特性を有することが示された（補足図3）。

両サンプルの最終的な平均カバレッジは約9×であったが、X染色体とY染色体のカバレッジは約5×であり、両サンプルが雄であることを示している。また、NGDデータ12をCTCおよびHXHと同じパイプラインを使用して再処理した。バリアントを検出するために、 DNA損傷パターン17を考慮したPythonで実装されたカスタム遺伝子型コーラーを使用した（補足ノート5を参照） 。
我々のアプローチにより、死後損傷に起因すると考えられる多くの偽陽性が排除されたことがわかった（補足図4）。