各種モジュールによって、
音を良くするモジュールを入れられる(俺はこれ目的だった)
要らないブロートウェアをADBのみの時より多く消せる
アプリをデータ毎バックアップ出来る
バッテリーの充電をよりコントロールできるようになる
GKIカーネルを使えば、バッテリーのむだ遣いを減らせたりやパフォーマンスが良くなったりする
好きなフォントを使える

古い端末でも、カスタムカーネルによりセキュリティパッチを受け取れるようになる

欠点は、Googleウォレットや各種銀行サービスとの戦いに明け暮れることになる
だから、最近はサブ端末のみルート化したり、決算用端末を分けている人が多いよ

正直、こだわりが無ければ昔ほどのメリットはない