そりゃ実機でも起こるならハード・ソフトの仕様でしかない
再現性の点から言えばGESTのほうが実装を間違っている
mGBAに擬似SGBモードがないのもそういう点があるかもしれん
mGBAもサウンドはノイズch以外は割と再現性高いと思うけどね

BGBは153以降にしたら
うちの環境だと何故かimetip.dllのエラーが頻発して
まともに動いてくれないから152で止めてる