履歴を保存する/しないの設定はない。
仕方ないので、

srcからclnch_mainwindow.pyを持ってくる
↓
clnch_mainwindow.pyの中の関数、appendHistoryの処理をpassのみに変更
↓
library.zip展開
↓
そこのclnch_mainwindow.pyoを削除して、代わりに変更済みのclnch_mainwindow.pyを入れる
↓
library.zipを圧縮し直す

てなことをバージョンアップごとにやっている。
pluginやconfig.pyからclnch_mainwindow.py内の関数の上書きはできない…よね？
ソースを追うぐらいは何とかできても、その辺がイマイチわからないんだぜ？