>>598
このスレに良く出てくる話だが
それはアナログ放送と同じ二重音声放送で、右と左に別の音声が入ってる
こいつはトラック毎に音声が入ってるマルチ音声しか処理できない

TS ならプレーヤーが判断して上手く再生できるかもしれないが
エンコするとステレオ扱いになるので一緒に再生される
XMedia Recode でモノラル音声にしてから(ビデオはコピーにすれば速い)
こいつで編集すると良い