今日のメールに色つけはできないけど、メール一覧 - 詳細 - もっと詳細 で「昨日/今日を使う」と"今日"に色つけする設定にすればいいんじゃないかな。

(?#c=00C0C0)今日

とか指定すれば今日が水色になるけど。