もっと正確に書きますと
\Extensionsフォルダから該当アドオンそのものが削除されます（--disable-extensionsで起動しても削除）
アドオンを\Extensionsに入れてリロードしても読み込めないようで強制的に無効化されます
アドオンを削除した上で再インストールすることはできますが、設定が全て消えるので困っています