GPLを勘違いしているのが若干名居るがコア機能がGPLアプリに依存してても
exeを叩いて標準入出力でパイプしているだけの疎結合ならGPL感染しない
一方でGPLアプリを同梱する時にはバイナリを再現するソースを要求に応じて出さなきゃいけないので
関連全ソースコミットバージョンが不明だとかそもそも自分ではビルド出来ない場合は同梱は避けるのが安全だな