>17,18,22
>ffmpegの配置位置が適切ならオプション部分は「 --external-downloader ffmpeg」だけでおk
これで行けました。ありがとうございます!
具体的には↓
youtube-dl -f bestaudio[acodec=mp4a.40.2] --external-downloader ffmpeg "URL"
普通にm4aで落とした後にffmpeg -c copyでコンテナ変換したものとバイナリ一致しました。
確かに時々DLが遅いときがあって気にはなりますが、再エンコはしてなさそうです。

>--exec "ffmpeg.exe -i {} -c copy {}.m4a"
こちらは、元の"TITLE.m4a"とコンテナ変更後の"TITLE.m4a.m4a"ができました。
後者もバイナリ一致しています。

>13
こんなオプションあったんですね。ありがとうございます。

>14,23
ffmpegは同じフォルダに入れてたんですが、youtube-dl -f m4a "URL" だと
コンテナはMPEG-DASHのままでした。

>15
ありがとうございます。バッチと直打ちでは変わってくるんですね。

>24
ソフトの信頼性が担保できないのでこういうのは避けてます。