3Dのメリットは
新衣装のパーツを作ればいいのでランニングコストが低い
3Dのデメリットは
初期費用がめっちゃかかる

2Dのメリットは
初期費用が低い
2Dのデメリットは
新衣装毎に作り直しな為ランニングコストが高い

ただし現代みたいな3Dだと勘違いするレベルのLive2Dも高額だからそれならみんな3Dで良いのでは?とも思う