送料改定で出品者負担の送料込みでも良いけど、おまとめだとややこしくなるんだが、
その辺はシステムで何とかしてくれるのか？

少なくとも商品価格と送料を分けたシステムでおまとめで複数買いの落札者が不利にならないようにしてくれ