CubaseはASIOGuardで、処理単位はバッファサイズのまま先読みっていう特殊な処理をしてるから
（選択トラックが自動でRec状態になる設定にしてる人は頻繁にそのトラックのリアルタイムモードへの変更も入る）
Steinbergのオーディオインターフェースが無難かもね（YAMAHAはSteinbergと協力してチェックしてるらしいので）

ASIOGuardをオフにして様子見てみれば、そのあたりが原因かどうかわかるかもね

あとはWin10が原因と思われる不具合はどのDAWでもいっぱい報告されてる
Appleの真似してちょくちょく根本的な部分のアップデートするようになったし
（以前のバグ取りメインのアップデートでも問題あるアップデートが結構あったのに）