ツールパレットはどのウィンドウを開こうがフロートで最前面なのは仕様
まあ、コントロールパネル上にツールを表示しておける様になってからツールパレットを開くこともなくなったが、元々A,P,C,Mキーくらい覚えておけばそうそうツール一覧に手を伸ばすことも無い

Pキーを押してる間だけペンシル、Pキーをダブルクリックでペンシルに切り替え
同様にA=矢印、C=ハサミ、M=ミュート、B=コンプ、等々
シフト＋「｀」でツール順送り