>>100 オーディオ変換の時に実時間で書き出すってのに✓入れてみて
実再生時間で変換するからちょっと時間掛かるけど
それで大丈夫だったら所々瞬間的な負荷が掛かってノイズになってる可能性はある

バッファ容量不足だったら不足した所は無音になるはずで、ノイズにはならないから…
クリップとかそういう自己的な問題じゃ無いなら、音源側の問題かと