ラスボスを倒した時点でアレシアが作り出した連鎖から開放されて
死による記憶操作も無くなってるんで12人の死は忘れられてないはず

あとゲーム中に関してはクラスゼロだけアレシアの影響下にあるんで
クラスゼロ14人同士でのみ記憶の改竄は起こらない

関連ネタバレとしてクラスゼロの記憶リセットが行われているのは世界崩壊によるリスタート時のみ
あの世界はアレシアが望むとある世界への門を開く為に異空間にて箱庭化された惑星で
12人が死を選んだ事によりアレシアの輪廻から開放されてようやく元の時間を取り戻した
なのでエンディングの後のレム達もごく普通に時間が経過して死を迎えてる