お答えします

拠点は最初の街の自宅かその近くに作るのが絶対有利ですね
結局ハムレットはお金さえあれば街に引きこもっていれば安全に生存できる
（アポカリプス以外）ので、安全で、お金が稼ぎやすい街に、拠点を作らない理由はないと思います
第一拠点が街で、そこから自由に第二拠点、第三拠点を作っていくのががいいと思います。

カバは二匹以上いれば増殖します。一匹で増えるかは未検証です。

パックンにケンカを売るアビゲイルを守る方法は僕もいろいろ考えましたが、
パックン養殖場をジャングル以外に１つ作って、それ以外の野良パックンは
根絶やしにしてしまうのがいいかと思います。
地面に肉か卵を置くとパックンが釣られて無防備になるので、
うまく誘導すればアビゲイルが上手に活躍してくれると思います。