LE版のフォロワーMODをSE版で使うことについて質問です

FaceGenDataをSSE NIF Optimizerで変換するとHeadPartsOnly設定にも関わらず画像右のように目がバグってしまいます
変換しないままだと左のように正常に見えます
https://i.imgur.com/LI4swmf.jpg

なので変換せずにMODを導入しようかと思うのですがその場合どんな問題が起きる可能性がありますか？
それか自分が何か認識を誤っているならそれについてご教授ください