259ですが、あれからMOD抜いたり、データをバックアップからかなり戻したりして、いろいろ調べてみましたが、
この現象って当初から起こりうる可能性があるバグみたいね・・・

ttps://steamcommunity.com/app/107410/discussions/0/4086396624009254947/

「ARMA3 OLDMAN CRASH PLANE」で調べると、Steamのスレッド以外にもいろいろ出てきた。

この現象が起こると、二度とフラグは戻らないようで・・・一からやりなすしかないと。トホホ・・・
デバッグモードとかで何とかならんかな。