ファイル一式バックアップしておいて、仮に現行ファイルをアップデートさせた後、バックアップファイルをそこに上書きしたらそれ以上自動更新しなくなる？それとも古いファイルを検出して自動更新の対象になる？
もし前者ならバックアップ取ってれば更新させてもいいのだけれども