データを消す場合はクラウド切った状態でやらないと駄目だよ。

(1) ゲームを終了させる
(2) 該当ファイルを削除し、クラウド設定でクラウドをオフに
(3) ゲームを起動させて何もせずに終了
(4) クラウドをオンにしてゲームを起動

このゲームの場合はそこまでデリケートじゃないから面倒な手順は必要ないけど、クラウドのデータを消すのはほんと面倒くさい。
上に書いたような簡単な手順でも消せなくて、セーブデータのゾンビ化と格闘するはめになる場合もしばしば。