MO2だとoverwriteになんかの残骸が残っているのかも
というかどういう入れ方してるかもわからないね
(直接ファイル配置、mo2/vortexなど)
あとSteamだとして整合性チェックだと増やしたファイルは消えないから完全にクリアするなら一旦フォルダごと消さないとダメ