キーボードのplistってどれだろう。
もしやcom.apple.systempreferences.plistですか…

外からスクリーン共有でキーボード初期設定を見ると、
モディファイキー画面に「キーボード選択」のポップアップメニューが出るな。
外からじゃなく直接開くとメニューはない。たしかYosemiteからなくなってた。