混乱とか業務がまわらないとか言ってますが、その混乱来年の今頃まで続いていると思いますか?
どうせどんなコードを入れたらいいかわからない、このマニュアルが詳しく書いてないからわからない、もっと業務に特化して何をしたらいいか1から10まで書いたものを用意してほしい、その程度のものではないでしょうか?
それらは2,3件案件こなせば解決しますよね?
わかったことは各部署でメモを作ってナレッジとして貯めればいいだけ
早ければ下期くらいには解消するのでは?

また今回の導入で楽になった組織、稼働が増えた組織があるのは知ってます
楽になった組織の人材を稼働が増えた組織に配置替えも考えてます。
サポート体制がまだまだなのはわかっていて改革やシステムから染み出した部分を補う新たな一元化組織の立ち上げなど次の手も考えてます

皆さんような次世代の経営を担う方々は、大きな視点で施策をみてください